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Antrea Pavlou

GdT math-bio : L'analyse expérimentale et computationnelle des autoréplicateurs bactériens
Jeudi, 7 Novembre, 2019 - 11:00 à 12:00
Résumé : 

La croissance microbienne est un problème d'optimisation dans le sens où l'allocation dynamique de ressources vers les fonctions cellulaires doit maximiser le fitness des cellules, par exemple le taux de croissance. Pour expliquer des observations en physiologie microbienne, des modèles d’équations différentielles ordinaires simples, appelés autoréplicateurs, ont été utilisés pour formuler le problème dans le cadre de la théorie du contrôle optimal et du contrôle en boucle fermée. Ceci a permis d’expliquer une variété d’observations en physiologie microbienne. Les profils d’allocation de ressources bactériens peuvent être quantifiés expérimentalement à l’aide de techniques de pointe en biologie moléculaire et en biophysique. L’objectif de la thèse de doctorat est (a) de généraliser les modèles d’autoréplicateurs afin d’obtenir une idée plus précise de l’allocation de ressources et (b) de valider les prédictions de modèle par une combinaison de gènes rapporteur fluorescents, microscopie de fluorescence, microfluidique, analyse d’image automatisée et algorithmes de traitement de signaux.

Institution de l'orateur : 
INRIA/LiPhy Grenoble
Thème de recherche : 
Probabilités
Salle : 
1 tour IRMA
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